Toyota Agya sebagai salah satu LCGC andalan Toyota memiliki masalah dengan mesin 1000ccnya. Masalah klasik mesin tiga silinder, yaitu getaran yang berlebih. Namun Toyota telah mengatasinya dengan mesin baru yang lebih canggih.
Kini Agya baru menggunakan mesin 1,0L yang telah dilengkapi VVT. Teknologi ini menurut Toyota akan mengurangi getaran secara signifikan. VVT merupakan teknologi khas Toyota yang dapat mengatur bukaan katup mesin secara elektronis.
Salah satu manfaat lainnya dari penggunaan VVT adalah efisiensi serta tenaga mesin yang bertambah. Konsumsi bahan bakar menjadi semakin irit, di angka 23 kpl menurut Toyota. Selain 1,0L tersedia juga mesin 1,2L untuk yang menyukai tenaga yang lebih besar.
Apakah Toyota masih berusaha mempertahankan segmen LCGC-nya? Kini LCGC sudah semakin ramai dan semakin kompetitif. Beberapa harga LCGC juga sudah tidak begitu murah lagi. Agya mendapat persaingan ketat dari Renault Kwid dan Suzuki Ignis yang memiliki harga yang tidak jauh berbeda.